Mazinkaiser es la máxima y definitiva creación del Doctor Juzo Kabuto, el genio que creó a Mazinger Z y diseñó al Gran Mazinger. Koji Kabuto descubre al Mazinkaiser completamente por accidente. Cuando el Mazinger Z sufre daños severos en batalla, el Pilder activa un protocolo automático y vuela a un hangar oculto tras una cascada. Allí, Koji ve un mensaje holográfico dejado por su abuelo Juzo, hablándole de Mazinkaiser y llevándolo hasta él. A partir de este punto, Koji usará el Mazinkaiser para combatir los ejércitos de brutos mecánicos comandados por el Dr. Infierno y posteriormente por el General Negro.
En la película que sigue a la serie, el Doctor Yumi alega que ha hecho mejoras a la aleación de Mazinkaiser, cuya potencia describe como "ilimitada".

ADVERTENCIA: El Episodio 4 contiene escenas de desnudos no aptas para menores de edad.

Episodio 1 - Batalla Intensa - El Doble Ataque de Mazinger
Episodio 2 - La Aparicion del Dios Demoniaco
Episodio 3 - Objetivo - Asesinar a Koji Kabuto
Episodio 4 - El Plan para Rescatar a Sayaka
Episodio 5 - Situacion Critica - El Instituto de Investigaciones Fotonicas
Episodio 6 - Koji Kabuto - Muerte en el Magma
Episodio 7 - Batalla Decisiva - El Castillo del Infierno Envuelto por las Llamas
Pelicula - Combate a Muerte Contra el General Negro